De opleiding tot arts-microbioloog duurt 5 jaar en omvat een leerfase en een applicatiefase. Tijdens de leerfase van bijna 3 jaar doe je stages over diverse thema’s waarbij je zowel over de laboratoriumpraktijk als de klinische toepassing leert. De thema’s in de leerfase zijn bacteriologie, virologie, parasitologie, mycologie, infectiepreventie en openbare gezondheidszorg. Daarna volgt toepassing van geleerde kennis in de applicatiefase tijdens de consultenstage van 1 jaar. Laboratoriummanagement wordt als lijnleren in de opleiding geïntegreerd. De opleiding bevat ook een 4 maanden verdiepingsstage in een thema naar keuze en een wetenschapsstage van 9 maanden.
In de OOR Leiden wordt klinische toepassing van de kennis in de vorm van het doen van consulten en het meedoen aan multidisciplinaire overleggen al vanaf het eerste jaar van de opleiding toegepast. Hierdoor doen AIOS veel ervaring op en dit maakt de brugfunctie van laboratorium naar kliniek al vroeg duidelijk.
De verschillende deelspecialismen binnen de microbiologie, zoals virologie en bacteriologie, werken binnen onze OOR nauw samen binnen de opleiding. Ook is er een goede samenwerking met collega’s van de infectiologie en kinderinfectiologie.